DNA@home

来自中国分布式计算总站
DNA@home
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开发者 Rensselaer Polytechnic InstituteUnited States.gif
版本历史 2010年10月18日发布 Linux 版本公开测试程序
计算程序 WindowsLinuxMac OS X
子项目
项目平台 BOINC 平台
项目类别 生命科学
项目状态 已结束&网站无法访问
官方网址 DNA@home
项目文献 分类:DNA@home 相关文献
http://volunteer.cs.und.edu/dna/rss_main.php 通过 RSS 获取项目新闻


DNA@home 是由美国伦斯勒理工学院主办的基于 BOINC 平台分布式计算项目,项目试图寻找人类基因规律。

项目简介

DNA@Home 的目标是探索是什么在调控 DNA 中的基因。 你曾经注意到表皮细胞与肌肉细胞截然不同,和骨细胞也是千差万别?实际上你身体里的每个细胞都拥有你基因组里的全部基因。这种区别是因为不是所有基因都一直处在开启状态。 根据细胞的类型和特定的时刻细胞要做的工作, 只有基因组的一个子集起作用,剩下的都被关闭。DNA@home 利用你的志愿计算机,采用统计学算法来揭开这种差异性调控的秘密。

基因调控的主要手段是转录层次的,一种叫做聚合酶的分子从基因的首端到末端阅读 DNA ,创造出信使 RNA 。 另一种叫做转录因子的分子连接在 DNA 上临近基因开始处,可以帮助恢复聚合酶或者妨碍/抑制聚合酶。 是否绑定了这些转录因子就决定了基因是处在开启还是关闭状态。不过通常情况下,科学家并不知道哪个转录因子负责调控哪个基因。

转录因子有“指纹”,一种特定的短而粗的 DNA 序列中的核苷酸“字母”模式, 但许多情况下我们不知道这些模式是什么。我们的软件会寻找在多个基因开始处大致相似,并在相关物种基因组相应位置大致相同的的短核苷酸序列。因为 DNA 序列非常庞大,由从数百万到数十亿个核苷酸组成, 而这些序列很短,而且只存在与一点和下一点之间,这项工作是真正的大海捞针,需要大量的计算能力。我们希望您的电脑能提供帮助。

我们当前的计划涉及处理结核杆菌的基因组来全面理解结核菌是如何实现它的功能的——这样其他人可以利用这个信息来阻断这个每年导致数百万人死亡的疾病的传播。我们还计划处理鼠疫耶尔森菌,腺鼠疫的致病原。

DNA@Home 由伦斯勒理工学院主办。

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