Proteins@home:修订间差异
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[[Proteins@home]] 是一个利用分布式计算在短时间内完成大量计算的大规模非盈利蛋白质结构预测项目。通过他们的网站可以了解: | |||
蛋白质的氨基酸序列决定了它的三维结构,或者折叠。相反的,三维结构可以兼容一个(相对)较大但是有限制的氨基酸序列集合。为一个给定的折叠列举允许的序列被称为逆蛋白质折叠问题。我们力图为大量已知蛋白质折叠解决这个问题(一个有代表性的子集:大约1500个折叠)。最昂贵的部分是为能够描述所有这些结构的能量函数建立数据库。对于每一个结构,我们考虑所有可能的氨基酸序列。令人惊奇的是,这在计算上是易进行的,因为我们的能量函数是很多对相互作用的总和。一旦这一步被完成,我们可以以一种更快更有效率的方式探索氨基酸序列空间。这一大规模绘制蛋白质序列空间将在预测蛋白质结构和功能,理解蛋白质演化以及设计新的蛋白质方面有所应用。通过加入这一项目,你可以帮忙建立能量函数的数据库并且通过潜在生物医药应用(帮助)发展科学的一个重要领域。 | |||
更多的信息,请点击链接: [http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/documentation2.php 项目总览]。 | |||
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2011年8月12日 (五) 22:53的版本
Proteins@home | |
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![]() Proteins@home logo | |
![]() Proteins@home 运行中的图形界面 | |
开发者 | |
版本历史 | 2006年12月28日 |
运算平台 | ![]() |
项目平台 | BOINC |
程序情况 | |
任务情况 | |
项目状态 | 运行中/开放注册 |
项目类别 | 生命科学类 |
优化程序 | 无 |
计算特点 | CPU密集: |
官方网址 | Proteins@home |
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[{{{rss}}} 通过 RSS 获取项目新闻] |
Proteins@home 是一个利用分布式计算在短时间内完成大量计算的大规模非盈利蛋白质结构预测项目。通过他们的网站可以了解:
蛋白质的氨基酸序列决定了它的三维结构,或者折叠。相反的,三维结构可以兼容一个(相对)较大但是有限制的氨基酸序列集合。为一个给定的折叠列举允许的序列被称为逆蛋白质折叠问题。我们力图为大量已知蛋白质折叠解决这个问题(一个有代表性的子集:大约1500个折叠)。最昂贵的部分是为能够描述所有这些结构的能量函数建立数据库。对于每一个结构,我们考虑所有可能的氨基酸序列。令人惊奇的是,这在计算上是易进行的,因为我们的能量函数是很多对相互作用的总和。一旦这一步被完成,我们可以以一种更快更有效率的方式探索氨基酸序列空间。这一大规模绘制蛋白质序列空间将在预测蛋白质结构和功能,理解蛋白质演化以及设计新的蛋白质方面有所应用。通过加入这一项目,你可以帮忙建立能量函数的数据库并且通过潜在生物医药应用(帮助)发展科学的一个重要领域。
更多的信息,请点击链接: 项目总览。
如何加入项目
该项目基于 BOINC 平台,简要的加入步骤如下(已完成的步骤可直接跳过):
- 下载并安装 BOINC 的客户端软件(官方下载页面或程序下载)
- 点击客户端简易视图下的“Add Project”按钮,或高级视图下菜单中的“工具->加入项目”,将显示向导对话框
- 点击下一步后在项目列表中找到并单击选中 Proteins@home 项目(如未显示该项目,则在编辑框中输入项目网址:http://biology.polytechnique.fr/proteinsathome/ ),然后点击下一步
- 输入您可用的电子邮件地址,并设置您在该项目的登录密码(并非您的电子邮件密码)
- 再次点击下一步,如项目服务器工作正常(并且有适合自身操作系统的计算程序),即已成功加入项目
更详细的加入方法说明,请访问 BOINC 新手指南 或 BOINC 使用教程。
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