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楼主: BiscuiT

[项目新闻] [BOINC] [生命科学类] GPUGRID

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发表于 2010-7-13 17:46:42 | 显示全部楼层
2010 年 7 月 13 日

自由配体结合成功&延续

在过去的几个月里,所有志愿者的默默运算一套旨在显示一个蛋白质自由配体结合(*IBUCH_esrever*)的任务。现在至少在 750 个模拟中有 1 个达到了目的。
视频:http://youtu.be/a3IsIQiEjeQ (需要翻墙)

祝贺这个兴奋的结果。但是,我们目前对这个事件缺乏足够的统计,我们需要去完善它。我们正在扩大(*IBUCH_esrever*)的试验,他们已经安排在任务队列中等候着你的领取!

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发表于 2010-8-25 22:07:51 | 显示全部楼层
2010-08-23

GPUGRID 的新刊物

感谢所有志愿者完成全部 *JAN* 任务,最终使得这个刊物能够发表:
J. Selent, F. Sanz, M. Pastor and G. De Fabritiis, Induced Effects of Sodium Ions on Dopaminergic G-Protein Coupled Receptors, PLOS computational biology, 6, e1000884 (2010).

下载链接:http://www.ploscompbiol.org/arti ... ournal.pcbi.1000884

这项工作我们可以展示钠离子如何调节一个重要的蛋白质受体 (dopamine D2 GPCR),为多种中枢神经系统疾病提供了治疗药物的途径(例如精神分裂、症帕金森氏病)。

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发表于 2010-8-28 11:15:04 | 显示全部楼层
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发表于 2010-9-3 20:00:41 | 显示全部楼层
2010-09-03

下线

今晚我们让服务器关闭,目前仍在对一个似乎出现问题的硬盘进行恢复。

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霊烏路 空 + 30 + 5

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发表于 2010-9-4 08:57:59 | 显示全部楼层
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发表于 2011-1-13 09:57:44 | 显示全部楼层
New Year, New WUs/experiment!
Happy New Year, In this binary day 110111, I am sending some (150) new WUs tagged as *EGFR* for you to crunch. It is a brand new project that we are starting. Its goal is to find the (molecular) cause for the resistance to some anticancer drug -which is quite exciting! More to come, ignasi 11 Jan 2011 12:07:30 UTC

新年新WUs/实验!
大家新年快乐,在这个二进制萌感强烈的日子110111里,我将大概150个新的标记为*EGFR*的WU送到服务器上供你们来当点心。这是一个我们启动的全新的项目,目标是寻找对某些抗癌药物存在抵抗性的分子机制。这相当的给力!接下来会有更多的~
ignasi 11 Jan 2011 12:07:30 UTC

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refla + 5 二进制萌感强烈的日子,赞!

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发表于 2011-1-22 09:37:19 | 显示全部楼层
Power down scheduled: Thu, Jan 27th 10am UTC+1
The server will be down for some minutes due to power maintenace operations in the building, next Thursday January 27th at 10am (UTC+1). 21 Jan 2011 11:09:45 UTC

停电计划:1月27日,星期四,UTC 9:00am 北京时间下午5点

由于建筑中的电力维护,服务器将停机数分钟
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发表于 2011-1-28 07:56:02 | 显示全部楼层
Server up again
The server is up again and all should get back to normal very quickly.

gdf 27 Jan 2011 10:01:25 UTC

服务器重新恢复
服务器已经重新恢复,一切都会很快恢复正常
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发表于 2011-1-31 22:29:49 | 显示全部楼层
31 Jan 2011 10:06:57 UTC
New task selection option
We are introducing the possibility for users to select between shorter (acemd2, approx 4 hours on GTX275 cards) and longer (acemdlong, 8 to 12 hours on GTX480) tasks. Simply go to your account preference to select which applications you want to crunch for. Long task are of course credited higher, but GPUs with less cores cannot simply compute them in time.

提供新的任务选择选项
我们提供了选择的可能性,让用户去选择运行较短的(acemd2,在GTX275上运行大约4个小时)以及较长的(acemdlong,在GTX480上运行8~12小时)的任务。直接到你的账户配置页面进行选择修改,以决定你想运行哪种程序。
较长的任务自然会多得一些分数,不过GPU的核心数较少的话可能无法在期限内完成计算。
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发表于 2011-4-14 09:45:30 | 显示全部楼层
"No new work" problems SOLVED
We have found what prevented most of users to receive work despite having WUs in queue. Everybody should be receiving work now. There's plenty of WUS to crunch!
13 Apr 2011 11:09:12 UTC

"无事可做"的问题已经解决
我们已经找到了实际上队列中有很多任务,但阻止大部分用户接到任务的原因。所有人现在都应该能够接到任务了,有很多的WU可以用来算哦!
2011年4月13日 11:09:12UTC
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发表于 2011-4-14 09:49:25 | 显示全部楼层
New science: AGG workunits
For some days I will be running 600 workunit chains named "AGG" in the "acemdlong" queue. They belong to an investigation on aggregation processes, e.g. those that lead to Alzheimer's disease.
13 Apr 2011 16:48:57 UTC

新的科学研究:AGG任务
一段时间内,我将把600个命名为“AGG”的任务链加到"acdmdlong"队列中。这些任务属于一项关于聚集性过程的调查研究,所谓聚集性过程,就是比如造成阿尔茨海默病的蛋白(的问题)
2011年4月13日 16:48:57 UTC

误:为什么不是ACG任务……
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发表于 2011-6-27 16:48:07 | 显示全部楼层
Problem with scheduler
In order to fix the problem that the scheduler was not releasing wus, we have switched two days ago to the matchmaker policy for the scheduler which is less strict. Well, it seems that it simply ignores all the rules, so we have now reverted to the old scheduling mechanism and will try some new fix. gdf 15 Apr 2011 8:04:38 UTC

15 Apr 2011 8:04:38 UTC
任务分发服务器故障
为了修复任务服务器不分发WU的问题,两天前我们将任务服务器切换到了“鸡血”模式,某种不严格的模式。看起来它只是简单的忽略了所有的规则,于是我们现在回撤到了旧的分发机制,并且尝试进行一些新的修复. gdf
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发表于 2011-6-27 16:50:29 | 显示全部楼层
Too many workunits: Please cancel them so that other can get them
We have probably fixed the scheduler now, as there is no work, please cancel the workunits downloaded in excess so that everybody else without work can finally get them. Many thanks, gdf 15 Apr 2011 8:31:57 UTC

15 Apr 2011 8:31:57 UTC
WU太多了!请大家取消手里的任务让别人也能接的到
我们可能已经修复了任务服务器,但是貌似没有WU了,请大家取消下载到得过多的WU以便其他没有任务的人能够接到任务,谢谢大家!gdf
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发表于 2011-6-27 16:59:08 | 显示全部楼层
Resuming WU supply: KKAL5
After hopefully settling the scheduler issue, I'm gradually reopening the WU faucets. I'll be sending KKAL5/6/... workunits in the standard queue, which take ~6h on a GTX275. In addition to belonging to a protein of great interest , they are also part of a new approach which hopefully makes the best use of the simulated time, re-evaluating each day (or so) the simulation threads that are more promising. (And no changes is required on your side.) If you are not getting WUs, please post in the "server and website" forum. 22 Apr 2011 18:56:14 UTC

22 Apr 2011 18:56:14 UTC
恢复WU供应:KKAL5系列
在充满希望地处理了任务服务器问题后,我正在逐渐打开WU的阀门。我将会发送KKAL5/6/...等一系列WU到标准队列,在GTX275上的时长约为6个小时。这些WU除了属于我们极为感兴趣的蛋白,同时也尝试了新的方法,使得我们能够最好的利用模拟的时间,每天重新评估最为可行的模拟线程数目(当然不需要在客户端进行任何的修改)。如果你得不到WUs,请在"server and website"论坛版块发帖。
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发表于 2011-7-29 19:40:37 | 显示全部楼层
本帖最后由 zglloo 于 2011-7-29 19:52 编辑

Crunch to fight cancer
Dear users, we are submitting several WUs (*EGF*) directly related with colorectal cancer research. We are collaborating with MDs & researchers at the Hospital del Mar here in Barcelona to characterize some previously unreported effects of a well-known drug for cancer. Thanks for your precious contribution. 27 Jul 2011 12:45:18 UTC

  各位用户 我们的几个任务发现与(表皮生长因子受体)与大肠癌的研究直接有关,我们正在和医院相关研究人员描述从未有过的影响报告,感谢大家的贡献
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