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UD癌症项目和其他类似项目的比较

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发表于 2005-10-29 11:03:19 | 显示全部楼层 |阅读模式
难得水一下

算起来运算UD已经有2年了,但如果有人来问UD和其他项目相比究竟有什么好的和不足的还真的搞不太明白。前段时间有机会对UD上的癌症项目重新研究评估了一下,以确定是否继续在上面投入运算力。下面就是我对UD癌症项目的一点新认识。

我们都知道UD的癌症项目有2个阶段,第1阶段用一个叫Think的软件,第2阶段也就是现阶段用的是叫Ligandfit的软件。重新评估关键就在现在用的Ligandfit上。它究竟能不能满足医学研究的需要?回答了这个问题就能解决我这个UDer是不是在UD身上浪费CPU时间。
查看UD主页里的癌症项目介绍,我知道Ligandfit是一个叫accelrys的公司搞的。接下来google了一下,显然accelrys在生物医药和生命科学方面的专业令人放心。
http://www.biotech.org.cn/news/news/show.php?id=23932
从上面的报道看出accelrys的产品非常成熟。
当然Ligandfit也有其不足,比如UDer经常抱怨的运算速度偏慢,没有Linux客户端。
我觉得既然是科学研究,精确的结果相对比运行速度要重要一点,况且已经用网格运算来加快总体处理速度了。没有Linux客户端确实让人遗憾,我的解决办法就是全部装windows

以上是我个人的一点看法希望能抛砖引玉。

PS: 以前对于WCG所研究的项目有所忽视,现在已经增加了WCG的运算力。不过其内存使用

[ Last edited by Snake_SH on 2005-10-31 at 14:55 ]
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 楼主| 发表于 2005-10-31 14:57:43 | 显示全部楼层
踢一脚
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发表于 2005-10-31 16:08:11 | 显示全部楼层
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发表于 2005-10-31 19:25:41 | 显示全部楼层
斑竹同志既然对 UD 进行了详细的研究,肯定对 Grid.org 的官方站点有相当的了解,我们目前正在英语区发动人力对 Grid.org 的官方网站进行翻译汉化工作,如果您有兴趣,请关注此帖:http://www.equn.com/forum/viewthread.php?tid=9505 ,谢谢!!!
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 楼主| 发表于 2005-11-3 23:52:22 | 显示全部楼层
好,我来看一下。不过我的语文不太好,自己理解没问题,写出来可能可以当笑话看。
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发表于 2005-11-4 03:40:42 | 显示全部楼层
我经常看grid.org感觉没有wcg的那个网站做得好,如果大家的机器好,不妨参加wcg,机器的内存至少要求512M!rosetta的意义也蛮重大的。
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发表于 2005-11-4 11:12:12 | 显示全部楼层
引用 gongmao1_2000 在 2005-11-4 03:40 时的帖子:
我经常看grid.org感觉没有wcg的那个网站做得好。

要不,我们在本论坛英语区发起翻译 WCG 的官方网站吧?大家有兴趣参与翻译不?
http://www.worldcommunitygrid.org/
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发表于 2005-11-4 11:37:06 | 显示全部楼层
512的内存,哎~~~~~~~~
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发表于 2005-11-4 11:43:51 | 显示全部楼层
官方的要求是384M
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发表于 2005-11-4 12:55:41 | 显示全部楼层
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发表于 2005-11-4 13:03:12 | 显示全部楼层
金山快译翻译出来的东西连金山快译自己都看不懂,更别谈能让人看懂了.....
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发表于 2005-11-4 13:45:28 | 显示全部楼层
我说要512M内存的是针对rosetta这个项目来的,这个项目主要是做人体蛋白计算的。还有另外一个项目是Ligandfit,这个是专门针对癌症的,有兴趣的朋友可以只算这个,在profile里面改。wcg这个网站是wcg项目的,它主要是运行rosetta的,目前而言。
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