开发中国自己的分布式应用的契机

小强

人类肝脏蛋白质组计划
--------------------------------------------------------------------------------
　　　　来源：科技日报

  
　　“国际人类肝脏蛋白质组计划”是继人类基因组计划之后的最大规模的国际性科技工程。11月21日，中国科学院院士贺福初在中国科协青年科学家论坛第80次活动上，就“国际人类肝脏蛋白质组计划”作了全面阐述，他认为，“中国人类肝脏蛋白质组计划”将多层次、全方位的组织和部署中国科学家系统研究肝脏蛋白质组，使我国能进一步在以肝炎、肝癌为代表的重大肝病的控制、诊断、防治与新药研制领域取得进展与突破，并提升我国生物医药产业的原始创新能力与国际竞争力。

　　从结构基因组学到功能基因组学

　　人类基因组计划的实施和初步完成为人类解开“基因序列———生命天书之谜”提供了绝好的契机，并且，它所带来的大量遗传信息正对生物医学的研究方式和医疗模式产生巨大的影响。生物学研究的重心逐渐从结构基因组学转移到功能基因组学。根据这种特点，贺院士认为，发展和应用针对全基因组或全系统的高通量、大规模的整体实验手段，利用结构基因组学提供的信息和材料研究基因的功能将成为这个时代生物学研究的主要特征。他解释说，功能基因组学的主要任务不仅仅是解析基因的功能，更要研究生物体生理功能相关遗传途径的调控和组织方式。由于遗传信息极大丰富，生物信息学将在功能基因组学研究中担当无可替代的重要作用；基因组的功能信息还可以通过基因表达芯片获得；蛋白质组学研究通过大规模分析蛋白质表达谱以及蛋白质间的相互作用，揭示细胞内所有蛋白质组成及其动态变化规律。此外，由于基因功能是在由细胞组成的多层次的复杂生命体中实现的，因此，功能基因组学的研究将会在极大程度上依赖于对模式生物的研究。

　　人类蛋白质组是国际生物科技战略制高点

　　随着人类基因组计划的完成，人类基因的注释与确认已成为生命科学面临的最重要任务之一。蛋白质是生命活动的功能执行体，人类基因组中绝大部分基因及其功能有待于在蛋白质水平上的揭示与阐述。据贺福初介绍，2001年，国际人类蛋白质组组织（简称HUPO）成立，同时提出了“人类蛋白质组计划”（简称HPP），蛋白质组研究已成为21世纪生命科学的焦点之一。蛋白质组学集生物技术手段、分析技术、信息技术和材料技术等之精华，采用了大规模、高通量、高速度的技术手段，通过研究全部基因所表达的所有蛋白质在不同时间与空间的表达谱和功能谱，全景式地揭示生命活动的本质，特别是人体健康与疾病的机制。蛋白质组是开发疾病防治诊治药物和技术的直接靶体库，人类蛋白质组已成为新世纪最大的战略资源之一，是国际生物科技的战略制高点，将直接关系到未来整个生物技术及相关产业的发展空间和市场份额，有限的蛋白质组资源将是各国国力世纪性角逐的主要“战场”。

　　我国第一次领导的重大国际协作计划

　　针对“人类蛋白质组计划”，贺福初介绍说，“人类蛋白质组计划”是继“人类基因组计划”之后最大规模的国际性科技工程，也是21世纪第一个重大国际合作计划，其首批行动计划包括由美国牵头的“人类血浆蛋白质组计划”和由我国牵头的“人类肝脏蛋白质组计划”（简称HLPP）。HLPP是第一个人类组织／器官蛋白质组计划，也将是我国第一次领导的重大国际协作计划。

　　控制肝病造福人类

　　人们都知道，肝脏是人体的第一大器官，是物质代谢、能量转换及供应的“枢纽”，是机体内多种重要信息调控分子的“集散地”，是机体内再生能力最强的器官，在人类生命活动中占有重要地位。同时，肝脏又是淋巴细胞以外最常见的病原体持续感染的场所，控制肝病的发生发展和提高肝病患者的生活质量事关国计民生，对现代医学提出了巨大的挑战。

　　贺福初认为，各国科学家包括我国科学家已经认识到蛋白质组学将为全面认识肝脏及其疾病提供了新的历史性机遇，通过深入的肝脏蛋白质组研究，必将发现一批肝脏疾病的新型诊断标志物、药物作用靶标和创新药物，正因为如此，它已成为全世界竞争的焦点。

　　据贺福初介绍，HLPP的战略目标是：主导人类第一个组织、器官、细胞的蛋白质组计划，为人类所有组织、器官、细胞的蛋白质组计划提供模式与示范；实现肝脏转录组、肝脏蛋白质组、血浆蛋白质组的对接与整合；确认或发现80％以上的人类蛋白质，在蛋白质水平上全面注解与验证人类基因组计划所预测的编码基因；借助肝脏蛋白质组与转录组数据，揭示人类转录、翻译水平的整体、群集调控规律；系统建立肝脏“生理组”、“病理组”；探索并建立一批新的预防、诊断和治疗方法。其科学目标是完成“二谱、二图、三库”任务：建立符合国际标准的肝脏标本库；构建蛋白质表达全谱和蛋白质修饰谱；绘制蛋白质相互作用连锁图和细胞定位图；发展规模化抗体制备技术并建立肝脏蛋白质抗体库；建立完整的肝脏蛋白质组数据库；寻找药物作用靶点和探索肝脏疾病防治诊治的新思路和新方案。

Lightalt

最重要的是实际操作

equn

实际操作并不难！重要的是有想法。就我看，中国的计算机科学家搭建一个分布式计算是没有问题的。

mooncat

以下是引用equn在2003-12-17 12:43:22的发言：
实际操作并不难！重要的是有想法。就我看，中国的计算机科学家搭建一个分布式计算是没有问题的。

目前就有一个可以实现，就是中国正在筹建中的那个射电望远镜，如果能在那上面做些文章，会非常的好。

equn

那个射电望远镜是否已经在建设中了？

equn

专访：最大射电远望镜将落户贵州

--------------------------------------------------------------------------------

http://www.sina.com.cn 2002/01/10 11:45   三联生活周刊

　　2001年底，中国国家天文台的“FAST”(大射电望远镜计划)项目预研究宣告结束，中国正试图通过建造大口径射电望远镜，参与探索外星文明计划。12月25日，为此记者专访了国家大射电望远镜操作委员会委员、国家天文台研究员彭勃博士。

　　记者:您相信有外星人吗？


　　彭勃:我当然相信。从概率来算，地球是太阳系的九大行星之一，那就是1/9的概率，太阳系又是银河系中3000亿分之一，分母变大了;银河系在宇宙中更是数不清，那你就说只有地球上有生物？还有，60年代天文学发现了121种星际分子，氨基酸等生命元素在这里已经存在了，生命只是一个组合问题，它的条件也不是那么苛刻。比如说一个闪电，加点臭氧，再加点亚美尼亚气体，就能形成生命。这个实验几十年前就在实验室做过。发现的时候就感觉到生命可能不是孕育在海洋，而是孕育在宇宙空间，它改写了生命的纪元。

　　记:现在哪些人在探索外星生命？

　　彭:对外星生命的探索可以说是一种“贵族科学”，成本非常昂贵，现在我们连做一些纯天文研究经费都很有限，所以这种工作只是一些人当成业余爱好在做。世界其他国家也有很多研究小组在活动，美国加州伯克利大学有一个“搜寻地外文明计划”(SETI)研究所，已经成立了四十余年，靠的是资助。最早是美国军方支持，上一次美国经济大萧条时，国会削减经费，把钱停掉了，以后美国企业家开始个人投资。

　　记:我们的“FAST”工程是怎么回事？

　　彭:FAST是SKA的一种方案，SKA是美国、澳大利亚、加拿大、荷兰、中国等11个国家共同达成的国际协作项目，又叫“平方公里天线阵列”，就是一平方公里的射电望远镜概念。整个项目计划用10亿美元，各国自行开发研制，谁的钱用的少，能达到SKA的科学目的，就选谁的方案。实际上这也可以说是科技界的一场奥林匹克，现在成型的方案有五种，我们有幸被排在第一。

　　记:为什么选择在贵州做这项工程？

　　彭:现在世界最大的是美属波多黎各305米的阿雷西博射电望远镜，1997年中我们制定了策略，要做世界第一大单天线，即使入选不了SKA，也可以有很多科学用途。但因为有重力变形、温度变形等条件限制，全可动天线世界上最大的只做到了100米，它是所有望远镜的工程极限，造价也是不可想象的昂贵。于是我们想到了地貌，在喀斯特地貌最为典型的贵州，我们找了两个县，就找到200米级的400个。我们最终选择了500米，因为从科学意义上说，它的面积是300米的2.3倍，可观测到比现在要弱10倍的天体。我们的项目被列为国家知识创新的首批重大项目，预算需要5个亿。它的球反射面直径是500米，分成1800片，每一片是15米，由金属材料构造，可以是网面金属材料，计划6到7年左右建成。

　　记:这样一个耗资巨大的项目，建成后可以给我们带来什么发现？

　　彭:SKA对现有望远镜技术是100倍的推进，我们的500米是现有10倍的推进，相当于两个数量级，它是奔向SKA过程中的一个重要的环节。即便是独立使用，也有作为世界第一流望远镜的作用。J.泰勒1974年用阿雷西博观测毫秒级的脉冲双星，证实了20世纪爱因斯坦惟一没有被验证的理论——引力波辐射，这项工作给他带来的是1993年诺贝尔物理学奖。另外，FAST一旦建成，它的巨大威力，将使人类寻找外星人的活动进入一个新的领域，10年前人类找到的类地系统只有一两个，10年来增加50多个，这必须归功于望远镜的更新。探测到的目标和望远镜的能力应该成正比，澳大利亚64米的望远镜只能观测到1颗类地星，美国的305米望远镜可观测到12颗，我们将建成的这台估计可以观测到1400颗。(记者庄山)

Lightalt

如果SETI，那么就重复了

mooncat

以下是引用Lightalt在2003-12-21 14:24:39的发言：
如果SETI，那么就重复了

我只是说在它上面做些文章，可没说让它加入SETI

duligavin

大家好，刚找到一些有潜力的国内项目连接。

FAST项目简介
http://www.bao.ac.cn/bao/LT/

开发者的BLOG相关
http://blog.sina.com.cn/boincproject
http://sunathome.bao.ac.cn
       
21 Centimeter Array (21CMA): Search for the First Light of the Universe
http://21cma.bao.ac.cn/index.php

kittyjia

不错。我一定会优先计算国内的项目

(Y)

不错，持续关注中！

老吴

我上次去南京大学计算机系，他们有一个专门的一个组是研究分布式项目的
不知道能不能做出点什么大的项目来啊