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GPU超算全球率先模拟完整的H1N1病毒

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发表于 2011-11-23 11:28:12 | 显示全部楼层 |阅读模式
http://www.pcpop.com/doc/0/735/735517.shtml

泡泡网显卡频道11月23日 英伟达(NVIDIA)公司今天宣布,中国研究人员现已在对抗流感的竞赛中取得了重大突破,利用英伟达Tesla GPU率先在世界上在原子级别上实现了使用计算机模拟整个H1N1流感病毒。

    中国科学院过程工程研究所 (CAS-IPE) 的研究人员 正在利用分子动力学模拟来作为窥探H1N1病毒原子结构的“计算显微镜”。Mole-8.5 GPU加速的超级计算机包含2200多颗英伟达Tesla GPU,利用该计算机,研究人员能够模拟整个H1N1流感病毒,从而能够证实当前针对该病毒的理论和实验认识。
    中科院过程工程研究所助理教授任瑛博士表示:“Mole-8.5 GPU超级计算机让我们能够实现此前完全不可能的科学研究。我们会为了控制流行病和制造抗病毒药物而开发出更有效的方法,在这一过程中,这种研究工作是非常重要的一步。”
    在实验室的试验中研究细菌和病毒是非常困难的,因为反应通常过于迅速而微妙,难以捕捉。在合适的环境条件下模拟数十亿个粒子极其复杂,在此之前超级计算机无法胜任。
    中科院过程工程研究所的研究人员通过开发出可利用GPU加速的分子动力学模拟软件,从而在模拟上实现了突破。 该软件在 Mole-8.5 GPU超级计算机上运行,这台超级计算机由288个服务器节点组成。 该系统每天能够完成 770 皮秒的模拟,3亿个原子或原子团的积分时间步长为1飞秒。   
    在中国,还有很多各种各样的科学研究正在进行,这些研究项目均利用配备 GPU 的高性能计算系统:
    ● 湍流模拟 —— 从研究飓风的形成到研究化工行业的混合过程,模拟湍流对诸多研究项目来说至关重要。  这一工作是由北京大学的研究人员完成的,他们利用位于天津超级计算中心的天河一号A GPU超级计算机来实现模拟。   
    ● 天气建模 —— 国防科技大学的研究人员利用天河一号A系统的WRF天气预报模型,模拟了一个长波辐射物理学模型,叫做RRTM_LW。GPU加速的模型实现了性能翻倍,让预报人员能够以更加精细的细节和分辨率创建天气模型。
    ● 聚变能模拟 —— 美国加州大学欧文分校的物理学家通过ITER聚变能研究项目的国际合作,正在利用天河一号A GPU超级计算机来加速Gyrokinetic Torodial Code聚变能模拟软件。
    如需了解中科院过程工程研究所的更多信息,敬请访问:http://english.ipe.cas.cn/。 点此了解高性能计算英伟达Tesla GPU的更多信息。
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发表于 2011-11-23 12:09:27 | 显示全部楼层
这个。。。放在这个论坛,新闻中的都是好消息!鼓舞人心!如果放在其他商业网站,肯定会有人说这是NV的软文!不过对于我来说不管是用什么,只要是能促进人类科学进步,并且确实起了作用,产生进步了,那就是好事。
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发表于 2011-11-23 14:08:35 | 显示全部楼层
上过程工程研究所的主页可以看到英文的新闻。木有中文的。。。
http://english.ipe.cas.cn/ns/Events/201111/t20111123_79243.html
http://english.ipe.cas.cn/ns/Events/201111/t20111123_79213.html

技术进步真的是让以前完全不可能做的实验成为可能。现在困扰研究者的主要是,到底应该用这个技术来研究什么问题了——这个新闻里木有讲。
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发表于 2011-11-24 19:06:47 | 显示全部楼层
这个应该对H1N1致病机理的研究和靶蛋白寻找一类有很大帮助的吧...鼓舞人心+10086~~
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发表于 2011-11-25 18:57:21 | 显示全部楼层
回复 3# feynord

可以做的事情很多啊,如果能让桑兰重新站起来的话,一定会很让人激动的

对了,说到桑兰,以你的专业判断,她是摔到哪儿啦?怎么就站不起来了?
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发表于 2011-11-26 23:45:59 | 显示全部楼层
回复 4# fengkai

    肯定是可以筛选筛选药物的,hoho

回复 5# refla

    木有关注她阿。。。大概是摔倒脑了吧。。。
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