WCG的新项目会是什么呢？

nekoko · 发表于 2011-7-30 18:44:27

本帖最后由 nekoko 于 2011-7-30 19:45 编辑

这几天果然如官方所说，接到了Beta Test的包了~
大概主要是两种包：

1、HCMD的测试包：猜测是对服务器的恢复情况进行测试所发出的包
2、被标记为BETA的包：这些包好像在跑vina。vina是一个类似于autodock的程序，也是scripps的产品：http://vina.scripps.edu/

也就是说，WCG下一步要上的新项目很可能还是生命科学类的，而且和蛋白的docking有关
至于是什么项目，目前实在是无从猜起，等闲了分析一下该项目的目录文件看看有没有什么发现

UPDATE：
找到了vina的输入文件beta13.target_ace.pdbqt
发现里边描述了一条蛋白，
DEAEASKFVEYDRTSQVWNEYAEANWNYNTNITETSKILQKNMQIANHTLKYGTQARKFDVNQLQNTIKRIKVQDLERALPAQELEYNKILDMETYSVATVHPNGSLQLEPDLTNVMATSRKYEDLWAWEGWRDKAGRAILQFYPKYVELINQARLNGYVDAGDSWRSMYETPSLEQDLERLFQELQPLYLNLHAYVRALHRHYGAQHINLEGPIPAHLGNMWAQTWSNIYDLVPFPSAPSMDTEAMLKQGWTPRMFKEADFTSLGLPVPEFWNKSMLEKPTDGREVHASAWDFYNGKDFRIKQTVNLEDLVAHEMGHIQYFMQYKDLPVALREGANPGFHEAIGDVLALSVSTPKHLHSLNLSDEHDINFLMKMALDKIAFIPFSYLVDQWRWRVFDGSITKENYNQEWSLRLKYQGLCPVPRTQGDFDPGAKFHIPSVPYIRYFVSFIQFQFHEALQAGHTGPLHKDIYQSKEAGQRLATAMKLGFSRPWPEAMQLITGQPNMSASAMLSYFKPLDWLRTENELHGEKLGWPQ
取出来blast了一下：
angiotensin-converting enzyme isoform 2 precursor [Homo sapiens]
貌似是一个锌脂蛋白，看起来是在试图研究某种作用于Zincin的药物么~~不好下结论
用来docking的分子是在是没有看懂，有机化学不及格，想象能力有限……

总之确认又是一个进行应用研究的项目了，剩下的只能等其正式上线了

jpegreader · 发表于 2011-7-30 19:03:07

又是蛋白docking？
感觉又是啥疾病吧……

xuyongchen · 发表于 2011-7-30 22:05:36

那个。。。。。为啥那么一大串描述的一个蛋白？从哪里看出来的？要是我绝对猜不出来。。。。。

xuyongchen · 发表于 2011-7-30 23:23:43

回复 1# nekoko

。。。。。我看着感觉就是乱码。。。。难道蛋白质这类物质现在都是用这样的看上去完全没有规律的字母表示的吗？实在是不了解。。。你们怎么分解呢？是按照几个字母代表一个啥（就像是密码子一样）还是有什么其他的规律？

凸手1 · 发表于 2011-7-31 02:35:20

看不懂

nekoko · 发表于 2011-7-31 03:28:07

本帖最后由 nekoko 于 2011-7-31 03:29 编辑

回复 4# xuyongchen

http://hi.baidu.com/barry_hk/blo ... 8b3a51d7887de5.html

单字母缩写一般用于数据库记录

xuyongchen · 发表于 2011-7-31 09:34:36

回复 6# nekoko

是这样哦，我还是以为是像ACGT这样的密码子构成的，看到其他的字母就没敢猜了

jpegreader · 发表于 2011-7-31 09:57:18

英语老师向我们展示过一个世界上最长的单词——也是描述蛋白质的……

vmzy · 发表于 2011-7-31 10:39:50

本帖最后由 vmzy 于 2011-7-31 10:42 编辑

新项目缩写是PRJX，已经加到统计系统了，估计很快会上线。

acp134 · 发表于 2011-7-31 10:59:33

回复 8# jpegreader

我怎么记得有种肺炎的名字也很长啊

panda7456 · 发表于 2011-7-31 11:48:58

的确是autodock的，我昨天去wcg的论坛里看到了

vmzy · 发表于 2011-8-8 21:05:10

Aug 5, 2011 5:57:12 PM
We will be running another test shortly using an updated version of the application and some new parameters.

Thanks,
-Uplinger
大意：
使用新计算程序和参数，继续测试。

特斯拉 · 发表于 2011-8-18 05:37:21

我怎么没有收到计算包？

nekoko · 发表于 2011-8-20 20:01:45

新项目怎么还不来呢？？急死人啦~~~

vmzy · 发表于 2011-10-7 12:18:53

才发现，统计图片，新增了一个prj-xix项目，期待新项目。

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