[BOINC] [生命科学类] RNA World

射命丸 文 · 发表于 2010-6-27 19:17:53

2010 年 6 月 26 日

目前 Michael 正在出席西雅图的 RNA 大会，看来不少人对与我们合作感兴趣，这些人中有些能提供完整的 trancriptome 序列，这将有助于我们在实验结果的基础上验证计算结果。

射命丸 文 · 发表于 2010-6-27 19:20:07

2010 年 6 月 27 日

寻求翻译者

目前 RNA World 项目的描述只有英文和德文。我们正在寻求帮助以尽可能多的翻译成其他语言，如果你愿意提供帮助请联系我们。

姫海棠 果 · 发表于 2010-7-12 00:08:21

2010 年 7 月 11 日

双语新闻
从今天开始，我们将对所有新闻精选两种语言发布：英语和德语

姫海棠 果 · 发表于 2010-7-15 16:29:35

2010 年 7 月 15 日

可能在本周末，我们将对 Linux 64 位系统发布新的 CMCALIBRATE 任务。

姫海棠 果 · 发表于 2010-7-26 08:32:19

2010 年 7 月 25 日

延后 CMCALIBRATE 任务的分发

这表示 CMCALIBRATE 任务已经准备就绪，然而看来在当前的 Rfam 10.0 数据库的数据组中有轻微的不一致，我们希望在问题明晰之后再发布新的任务。

姫海棠 果 · 发表于 2010-7-27 22:39:09

2010 年 7 月 27 日

发布 CMCALIBRATE 迷你任务
我刚针对 Linux-x64 上传了一套小型的新的基于 Rfam-10.0 的 CMCALIBRATE 任务。

zyll · 发表于 2010-7-27 23:25:30

迷你任务多大？多长时间？

射命丸 文 · 发表于 2010-7-27 23:27:34

回复 71# zyll

你用 Linux-64 的话可以去试试。。

姫海棠 果 · 发表于 2010-7-31 21:39:21

2010 年 7 月 31 日

Rfam 10.0 的问题得到解决，相应的任务发布

在解决了与最新发布的 Rfam 数据库的一个小问题后，我们现在已经准备好并上传了那些新奇的任务到 RNA World 的服务器，这些任务将运行于 Linux x64 的机器上。
最大的基于目前 Rfam 10.0 的 CMCALIBRATE 任务的运行时间，以主频为 2.4Ghz 的 Intel P8600 CPU 为例，预计大概需要 72 小时 50 分钟。
绝大多数的任务，将只需要 1 小时左右（大约在 1446 个任务中只有 10 需要运行超过 20 小时）。
我希望这在无存盘点上是可以接受的。

zyll · 发表于 2010-7-31 23:13:49

还是弄存盘点吧，暂停再从头算很不爽啊

姫海棠 果 · 发表于 2010-8-13 23:18:01

2010-08-13

最后一轮 Rfam 10.0 CMCALIBRATE 任务

载有 Rfam 10.0 的 CMCALIBRATE 种子队列已经基本完成，因此我们打算在本周某些时间供给余下的队列。
同样的，接受挑战的仍然是 Linux x64 的机器。这一次，最大的运行时间（intel P8600 CPU，2.4Ghz）需要惊人的 285 小时 - 但通常这样的鬼东西在 1445 个任务中才会出现一个。

姫海棠 果 · 发表于 2010-8-16 08:58:50

2010-08-16

如之前所公告，基于 Rfam 10.0 的第二套 CMCALIBRATE 任务已经上传到服务器，一旦目前的任务（CMSEARCH）的存档完成将马上开始计算。

姫海棠 果 · 发表于 2010-8-21 19:59:41

2010-08-21

病毒检查程序的问题 - 误报

最近几天，一些最新的病毒扫描程序，如 AntiVir，把 RNA World 的 graphics_0.06_windows_intelx86.exe 进程报告为病毒。
对于这类不完善启发式侦察的软件，这是一个误报。我们已经通知了该反病毒公司 AntiVir 并且（在我们写这个帖子的时候）他们确定了这不是病毒文件。
因此这个误报侦察会在病毒扫描软件的下一次更新的时候修正。
但是，如果你的是 Windows 操作系统，你必须立即采取行动，防止你机器上的 RNA World 任务一个又一个的被封杀。
如果该公司在一段长时间还没有修复这个问题，你需要把 RNA World 的工作目录列入排除扫描的列表中。
请注意，RNA World 将永远不会分发恶意软件！感谢用户到我们的论坛报告这个问题，这么做让我们可以详细的检查并解决问题。

姫海棠 果 · 发表于 2010-8-21 20:00:41

回复 77# 姫海棠　果

以前我也用过小红伞。。就是烦不了它什么鬼都报。。简直神经病。。囧

姫海棠 果 · 发表于 2010-8-25 22:21:58

2010-08-24

新任务信息面板

我们已经定制了一个小脚本，生成一个概述 CMCALIBRATE 任务的图表
参考下面的图形（SEED，FULL，COMBINED）的链接。我们打算完全自动化实现这个。很快会提供一个显示网址在服务器状态页面中。

SEED: http://www.rnaworld.de/rnaworld/cmc_rfam10_seed.png
FULL: http://www.rnaworld.de/rnaworld/cmc_rfam10_full.png
COMBINED: http://www.rnaworld.de/rnaworld/cmc_rfam10_both.png

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