Rosetta有啥新进展没？

bi_bibi

24小时开机，除了得分有变化，都不知道我们的努力有啥进展没呢

Tynox

http://boinc.bakerlab.org/rosetta/rah_old_potd.php见这页吧.
貌似rosetta的成果都体现在其他方面.官方也没说什么吧.应该是有进展的.

feynord

当然有进展。
Rosetta主要是改进算法的项目，也就是让我们能够越来越准确地预测蛋白质结构。它的组织者David Baker研究组每年都会发表高水平的论文，并且提供不断改进的程式来帮助其他的研究人员预测蛋白质结构。
可以肯定，每篇论文，每次改进都与大家的贡献是分不开的：）

Baker研究组最近的论文可以参见：
http://depts.washington.edu/bakerpg/publications.html


楼上那页是每日之星吧……那我就稍微解释一下：）

Jun 27, 2009
Predictor of the day: Congratulations to alinmesser (Team ROMANIA@BOINC.RO) for predicting the lowest energy structure for workunit Docking_benchmark_natives__1EO8.bound.mppk.pdb.gzdock_score12_hi.xml_12443_0 !

大意：祝贺alinmesser预测出了任务包XX的能量最低结构！
为什么是能量最低结构呢？因为我们无论是蛋白质结构，还是蛋白质与配体（药物分子）的结合能力，都是能量约低越稳定，因此能量是一个重要的判断标准。我们预测一个蛋白质结构的时候，能量最低的结构最有可能是天然的结构（真实的结构）。而预测蛋白质与配体的结合的时候，能量越低说明结合力强，这个配体理论上也更有可能成为药物。

而任务包的名字是：Docking_benchmark_natives__1EO8.bound.mppk.pdb.gzdock_score12_hi.xml_12443_0
Docking是对接的意思，即预测蛋白质和配体的结合情况。
1EO8是蛋白质的PDB编号，可以在www.pdb.org上查这是什么蛋白。1EO8是INFLUENZA VIRUS HEMAGGLUTININ COMPLEXED WITH A NEUTRALIZING ANTIBODY，也就是含有抗体的流感病毒血凝素蛋白（流感病毒名称如H1N1，里面的H就代表血凝素）。
benchmark_natives的意思可能说这个任务可能就是一个基准测试，将1EO8中本身含有的抗体对接到血凝素上。

呵呵，说明Rosetta也在跟风做流感呢。

附：蛋白质1EO8的结构图。

[ 本帖最后由 feynord 于 2009-6-29 15:51 编辑 ]

Tynox

还是楼上的专业啊