D2OL:客户端软件

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开始

(D2OL)™实际上是二个程序同时运行:引擎和客户端。引擎在您的系统栏里默默运行。

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客户端在您的任务栏象一个普通窗口运行。

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引擎测试候选药物并报告Conformers。当候选药物被分析时客户端显示当前候选药物和Conformers。当您开始,无论从开始菜单或在您的桌面上的快捷方式,引擎和客户端程序运行。由于引擎是一个单独的程序,您能关闭客户端而引擎将继续正常工作。

注意:当您关上客户端窗口,引擎将继续在系统栏运行。如果您想再打开客户端窗口,双击在系统栏的(D2OL)™图标 。如果您看见(D2OL)™图标在系统栏,不要重新从开始菜单再次运行(D2OL)™。这样做将导致一次运行多个引擎,而不支持这种工作模式。如果您在系统栏看不到(D2OL)™图标,可以这样做。

控制任务

即使(D2OL)™任务只使用您的额外计算资源,您仍可以选择暂停引擎的当前任务。当引擎被暂停,系统栏图标将由变为,当前目标将停止转动。您可以在任何时候恢复任务。

退出

想退出(D2OL)™ ,用鼠标右键单击系统栏图标选择退出。当您在系统栏看不到图标,您就知道引擎已经退出了。

客户端

客户端使您知道引擎到底在做什么事。

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1区域显示您的引擎当前分析的目标。目标将转动除非您暂停了任务(详见本文1.1节)。

2区域包含一般(D2OL)™控制。

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A. 只有您暂停了任务才可用,按这个按钮恢复任务(详见本文1.1节)。

B. 只有任务运行才可用,按这个按钮暂停任务(详见本文1.1节)。

C. 按这个按钮配置(D2OL)™属性。

D. 按这个按钮打开“关于”窗口。

E. 按这个按钮用您的默认浏览器浏览(D2OL)™网站。

欲知详情请浏览FAQ

3区域显示当前候选药物和一些最近分析的最高的Conformers。点击查看候选药物按钮在区域(4)查看当前候选药物。点击列表中的Conformer在区域(2)查看它。如果这个区域是空,确信您的引擎没被暂停(详见控制任务)然后在几分钟后再检查一下。

4区域显示当前所选的结构的渲染图和题头显示(HUD)关于候选药物的摘要信息或显示当前conformer。

5区域包含对区域4的所有控制。

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A按这个按钮隐藏或显示题头显示

B按这个按钮显示或隐藏统计数据。

C按这个按钮显示或隐藏当前广播消息。

D按这个按钮放大。

E点击圈子里任何地方设置自转控制杆,上面的候选药物结构图将根据控制杆位置转动。点击圈子的中心终止所有运动。

F按这个按钮缩小。

G按这个按钮显示或隐藏原子名称。

H点击滑条改变细节级别。

设置

属性窗口包含允许您调整您的(D2OL)™客户端设置的三页。

  1. 常规
  2. 网络
  3. 更新

常规属性页

选择这个复选框让引擎每次运行自动运行客户端。

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网络属性页

多数用户使用直接连接。如果您在防火墙后运行(D2OL)™,请选择合适的代理服务(HTTP或SOCKS)。然后指定主机和通信端口以使用代理。

需要连接协助,请发送电子邮件到help@D2OL.com,并附上您的计算机和网络设置的说明。

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更新属性页

这页允许您决定(D2OL)™ 将怎么处理自动更新。(D2OL)™默认在更新之前将等待手工确认。您也可以指定自动模式当检测到新版本将自动采取行动。您必须指定您是要自动模式开始更新程序或放弃。您还可以设置自动模式在采取指定行动之前的等待时间。

注意您的客户端将不能连接到我们的服务器和贡献除非您运行最新版本的(D2OL)™软件。

到本文第4节浏览更多关于更新过程的信息。

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更新

当检测到新版本,(D2OL)™必须连接到系统进行更新。在更新过程中下面窗口将显示不同的信息页以描述当前的更新状态。

第一页显示更新的摘要。更新的大小并显示用56k调制解调器下载时估计所需的时间。如果您打开自动模式,自动模式的当前状态显示在左下方。关于配置自动模式的信息请浏览自定义客户端。

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按OK开始或Cancel拒绝更新。

这页显示更新的进度。当下载和安装新版本时,在进度栏显示完成百分比。如果由于种种原因您必须中止更新按Cancel,您可以在以后的时间通过再次运行(D2OL)™完成更新。

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如果在更新过程中发生了错误,您会看见这页。按OK,通常会自己更正错误。如果在尝试了几此以后(D2OL)™没有更新,请把错误的简要说明发送到info@D2OL.com。

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一旦更新过程完成(D2OL)™重新启动,将完全最新到新版本。

高级功能

统计

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这个区域显示您的客户端的统计数据。如果这个不可见,按STATS按钮(详见本文第2节)。

  1. 您的客户端已处理的候选药物的总数。
  2. 您的客户端现存可用的候选药物的数量。客户端有缓存因此既使当您的计算机没有连接到互联网时仍能处理候选药物。
  3. 当前候选药物的开始处理时间。如果时间是"Pending…"代表任务当前没有运行。当客户端开始后它需要几分钟进行任务预处理。如果您选择暂停任务时间也会是"Pending…"(详见本文1.1节)。
  4. 上次已完成任务上传至(D2OL)™的时间。如果时间是"Pending…" 请运行您的客户端直到任务完成。

候选药物HUD

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这个区域显示关于当前候选药物的信息(详见本文第2节)。如果这个不可见,按HUD按钮(详见本文第2节)。如果您想看Conformer HUD,点击"CANDIDATE IN PROCESS"区域选择候选药物进行查看。

  1. 当前候选药物的名字。
  2. 这个计数器代表最近在处理中生成的Conformer估计值(详见FAQ)。
  3. 这个计数器代表最近在处理中的Conformer估计能量。
  4. 当前在处理中的Conformer的名字。

Conformer HUD

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这个区域显示关于所选的Conformer的信息(详见本文第2节)。如果这个不可见,按HUD按钮(详见本文第2节)。如果您想看候选药物HUD,点击Conformer查看。如果Conformer区域为空,请等待Conformers处理。当Conformers处理完成后将出现。

  1. 所选Conformer的名字。
  2. 由基因算法生成的总估计值(详见FAQ)。
  3. 总估计能量。
  4. 关于Conformer最终构造的附加统计数据。
  5. 最终估计的能量(详见FAQ)。