GPUGRID
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这是一个新颖的分布式超级计算项目,该项目利用志愿者电脑里的显卡来完成科研用途的高性能生物分子模拟。志愿者们计算该项目所做的分子模拟是科学家们所进行的一些最普通的分子模拟,但是同时也是对计算性能要求最高的一种模拟,这些模拟通常需要一台超级计算机。
通过在高性价比基础架构上运行超级计算级的应用程序,GPUGRID 在 NVIDIA GPU 上的运行开创了志愿者计算的先河,并将极大地影响人们从事生物医学研究的方式。
该项目由 PS3GRID 项目转变而来(可合称为 PS3GRID/GPUGRID),基于 BOINC 平台的 PS3GRID 最早仅支持在 PS3 的软硬件平台上进行计算,之后才加入了对 GPU 计算 的支持。
注:此项目没有CPU运算程序,因此不能使用CPU计算。
如何加入项目[编辑]
该项目基于 BOINC 平台,简要的加入步骤如下(已完成的步骤可直接跳过):
- 下载并安装 BOINC 的客户端软件(官方下载页面或程序下载)
- 点击客户端简易视图下的“Add Project”按钮,或高级视图下菜单中的“工具->加入项目”,将显示向导对话框
- 点击下一步后在项目列表中找到并单击选中 GPUGRID 项目(如未显示该项目,则在编辑框中输入项目网址:http://www.gpugrid.net/ ),然后点击下一步
- 输入您可用的电子邮件地址,并设置您在该项目的登录密码(并非您的电子邮件密码)
- 再次点击下一步,如项目服务器工作正常(并且有适合自身操作系统的计算程序),即已成功加入项目
更详细的加入方法说明,请访问 BOINC 新手指南 或 BOINC 使用教程。
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立即参与[编辑]
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项目背景[编辑]
该项目主要进行全原子分子动力学模拟相关的计算工作,目前主要包含如下几方面的实验内容(欲了解更多内容,请参阅项目背景页面):
- D2多巴胺受体在离子强度作用下的生理反应的分子模拟
- SH2和多肽配体之间亲合力的分子模拟
- 磷酸丙糖异构酶(TPI)的分子模拟
- 前反向指导分子动力学
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