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计算速度是快还是慢呢？

计算速度是快还是慢呢？

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[02:27:21] Protein: p685_L939_K12M_ext_355K
[02:27:21] - Run: 63 (Clone 85, Gen 2)
[02:27:21] - Frames Completed: 4, Remaining: 396
[02:27:21] - Dynamic steps required: 4950000
[02:27:21]
[02:27:21] Writing local files:
[02:27:21]
[02:27:21] parameters work/wudata_01.prm
[02:27:21] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite) successful.
[02:27:22] - Writing "work/wudata_01.xyz": (overwrite) successful.
[02:27:22] - Writing "work/wudata_01.prm": (overwrite) successful.
[02:27:24] - Writing "work/wudata_01.key": (append) successful.
[02:27:24]
[02:27:24] PROJECT="work/wudata_01", NSTEPS=4950000, DT=2.0000, DTDUMP=25.000000
, TEMP=355.00
[02:27:24] TINKER: Software Tools for Molecular Design
[02:27:24] Version 3.8 October 2000
[02:27:24] Copyright (c) Jay William Ponder 1990-2000
[02:27:24] portions Copyright (c) Michael Shirts 2001
[02:27:24] portions Copyright (c) Vijay S Pande 2001
[02:38:36] Finished a frame (5)
[02:50:56] Finished a frame (6)
[03:02:44] Finished a frame (7)

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Re: 计算速度是快还是慢呢？

引用:

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最初由 水鬼 发布
计算速度是快还是慢呢？

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[02:27:21] Protein: p685_L939_K12M_ext_355K
[02:27:21] - Run: 63 (Clone 85, Gen 2)
[02:27:21] - Frames Completed: 4, Remaining: 396
[02:27:21] - Dynamic steps required: 4950000
[02:27:21]
[02:27:21] Writing local files:
[02:27:21]
[02:27:21] parameters work/wudata_01.prm
[02:27:21] - Writing "work/wudata_01.key": (overwrite) successful.
[02:27:22] - Writing "work/wudata_01.xyz": (overwrite) successful.
[02:27:22] - Writing "work/wudata_01.prm": (overwrite) successful.
[02:27:24] - Writing "work/wudata_01.key": (append) successful.
[02:27:24]
[02:27:24] PROJECT="work/wudata_01", NSTEPS=4950000, DT=2.0000, DTDUMP=25.000000
, TEMP=355.00
[02:27:24] TINKER: Software Tools for Molecular Design
[02:27:24] Version 3.8 October 2000
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比较快

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要 12 分钟才算出一个 frame 啊，我的可是 P4 2.4G ＋ 2GB 内存的啊。

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最初由 水鬼 发布
要 12 分钟才算出一个 frame 啊，我的可是 P4 2.4G ＋ 2GB 内存的啊。

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很正常，不过可能前面的frame难算

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最初由 水鬼 发布
要 12 分钟才算出一个 frame 啊，我的可是 P4 2.4G ＋ 2GB 内存的啊。

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最初由 Nature 发布

看你算的内核程序是tinker，不是gromacs，后者支持3dnow/sse，比前者快。不过这也和正在算的蛋白质有关，而且完成时credit越多，就要花费更长的时间。
p4的fpu不怎么样，如果没有sse/2优化的话……

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400的WU也就是protein 393都用tinker，因为是老WU嘛

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Folding@home Client Version 3.24

用 3.25 的测试版会不会快一点？

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没用
因为实际计算的是FahCore_78.exe这个文件
而不是winFAH.exe或FAH3Console.exe

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QQ:81081347
msn:[email protected]
欢迎大家加入
“在家搜索外星智慧SETI@home和蛋白质折叠Folding@Home ”的行列
我的小组:SETI@moon与FAHChina共同期待您的加入

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p4如果没有sse/2优化的话根本不是axp的对手：

Nature 上传了这个图片:

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最初由 水鬼 发布
Folding@home Client Version 3.24

用 3.25 的测试版会不会快一点？

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