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CAS@home 官方更新(2012下半年)

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发表于 2013-2-18 13:58:03 | 显示全部楼层 |阅读模式
本帖最后由 wenjingwu 于 2013-2-18 15:16 编辑

大家好,
2012年下半年度,CAS@home整个项目取得很大的进展,我们将两个应用程序(清华大学的纳米技术研究软件LAMMPS和中科院计算所的蛋白质结构预测软件TreeThreader)移植到CAS@home计算平台。在移植过程中,我们遇到种种问题,因此投入了大量的人力在改善应用程序的稳定性上。


LAMMPS:
LAMMPS应用程序2012年5月正式上线,从2012.9到目前为止,我们一共更新了13个版本(当前的稳定版本是1.29)。在这个版本里,我们已经将错误主机率(错误主机是指没有成功运行过任何作业的主机)从31%(版本1.16)降低到5%(版本1.29), 这个是国际上志愿计算应用所能接受的主机错误率范围。
从上线开始,LAMMPS共获得 62万的有效CPU小时,完成了20个对动态分子进行模拟的任务。目前,这些数据需要被送往清华大学,等待科学家的后期处理。



TreeThreader
TreeThreader应用程序于2012.9月正式上线,到目前为止,我们一共更新了18个版本(当前的稳定版本Windows为1.17, Linux为1.18)。错误主机率由34%(版本1.00)降低到27%(1.17)。但是由于应用程序本身在某些主机上还存在问题。计算所的开发人员还在对此进行调试,以实现一个较低的错误主机率。
从上线开始,TreeThreader共获得了9.5万有效CPU小时,完成了约1700条蛋白质序列的结构预测,目前还有大约6000条蛋白质序列需要进行预测。志愿者们可以按照如下的方式,查看自己所参与计算的蛋白质序列的被预测的结构:
http://casathome.ihep.ac.cn/forum_thread.php?id=173#890
我们目前正在编写一些程序,定期统计各个志愿者所参与的蛋白质序列预测,希望通过邮件形式,定期给志愿者一个反馈。


请参加如下页面:
CAS@home应用程序版本发布历史:
http://casathome.ihep.ac.cn/appversion.html

CAS@home应用程序错误主机率统计:
http://casathome.ihep.ac.cn/faultyhosts.html

CAS@home的项目统计:
http://casathome.ihep.ac.cn/cas_stats.html

在论坛方面,请大家原谅在2012年下半年,我们对Equn网站的疏于交流。CAS@home项目很重视中国的志愿者,也很重视Equn这个社区。但是目前CAS@home的团队还很年轻,在项目管理方面还在向国外其他成熟的项目进行学习。请大家相信,CAS@home这个项目会长远发展下去。CAS@home项目的宗旨不是为了发文章,捞科研资本,而是要搭建这个分布式计算的平台,成为广大志愿者和科学应用之间的一个桥梁,将广大志愿者所贡献的计算资源提供给有迫切需求的科学计算工作者们使用!

此外,CAS@home准备在2013年,在计算中心内部聘请一个兼职的论坛管理员,改善对Equn社区的交流。
也欢迎大家踊跃到CAS@home的官方论坛上发帖讨论,特别是对于作业的错误信息,请将相关消息发送到论坛的Number Crunching里。提前谢谢配合!

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发表于 2013-3-14 23:06:09 | 显示全部楼层
这个帖子喂神马木有人顶?我不会违规了吧?
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发表于 2013-4-23 20:54:58 | 显示全部楼层
为什么我的计算程序还是1.21版本?
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发表于 2013-4-23 23:03:16 | 显示全部楼层
gd po
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