找回密码
 新注册用户
搜索
楼主: wenmao

Foldit —— 在线蛋白质折叠游戏

[复制链接]
发表于 2008-5-10 21:50:46 | 显示全部楼层
你们玩的时候 wiggle时候  我的怎么cpu100%?
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-10 22:15:06 | 显示全部楼层

回复 #16 zglloo 的帖子

貌似是CPU计算位置
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-10 22:28:55 | 显示全部楼层

回复 #17 duligavin 的帖子

应该  不会现在正在  艰苦看是否有相关的 类似官方解释!
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-10 23:23:43 | 显示全部楼层
刚刚退出程序后,现在用帐号登陆很慢了。TIMEOUT
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-10 23:30:02 | 显示全部楼层

回复 #18 zglloo 的帖子

的确是计算~~~局部优化的计算~~~跟rosetta是一样的~~~
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-11 09:36:51 | 显示全部楼层

无法登陆

无法登陆的时候,经过今天早上反复登陆还是可以了。这里有个类似讨论:http://www.fold.it/portal/node/182514

看来是网站的原因,http://www.fold.it/portal/node/172673

Unable to select database

We were able to connect to the MySQL database server (which means your username and password are okay) but not able to select the database.

The MySQL error was: .

Currently, the database is drupal. The username is rp and the database server is db1.

    * Are you sure you have the correct database name?
    * Are you sure the database exists?
    * Are you sure the username has permission to access the database?

For more help, see the Installation and upgrading handbook. If you are unsure what these terms mean you should probably contact your hosting provider.

[ 本帖最后由 duligavin 于 2008-5-11 09:53 编辑 ]
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-12 04:39:39 | 显示全部楼层
稍微写一点经验~~~
要玩好这个游戏首先要对蛋白质有一点知识。蛋白质由氨基酸通过氨键链接构成,而我们看到的主干结构(螺旋、片状物)就已经是经过一点折叠形成的超二级结构了。当然,这还不算完,我们的任务就是把这些超二级结构组合起来使能量越低越好,这样才能得到高分。还有一点补充的知识可以在图中看到。
下面说说技巧。在一个Puzzle刚开始的时候,首先要想好大概怎么折叠会比较好,然后用橡皮键把想要拉近的部分连接起来。橡皮键的使用很简单,在分子的一部分用右键拉出去放到分子的另一部分就行了。想要去掉的话也很容易,那东西旁边会有个小叉,点掉就是了。好了,连接好之后Wiggle一下,你会注意到分子就按照你的意思大概折起来了。Wiggle完之后Shake一下,然后去掉橡皮键再Wiggle一下Shake一下,分子就基本上叠好了。
但是这样还不够高分,怎么办呢?我们可以按照我的图上说明的几个原则稍微拉动一下整个分子。如果你想某些部分在你拖动的时候保持不动的话,用右键点击一下,这个部分就会被蓝色覆盖,也就是锁起来了。解锁也是用右键点击。注意在这里锁定对于Wiggle无效。稍稍拉动分子之后,Wiggle一下Shake一下(以后简便就叫W-S了~~~),分数就有可能提高。
接下来就是耐心了。不断摇动一下分子,然后W-S一下,如此重复。如果效果实在不好的话,可以Reset Puzzle重置一下用别的想法重新再来。
有时候Shake完之后再Shake一下还会有几分可加,所以可以试试。另外,Wiggle的算法就是在Rosetta里边用的调整算法,所以很占CPU,如果大家Wiggle后看见分数没怎么增加的话就赶快停了,免得浪费。
似乎差不多就是这样了~~~
foldit.jpg

评分

参与人数 1基本分 +10 收起 理由
Youth + 10 精品文章

查看全部评分

回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-12 04:49:37 | 显示全部楼层
对了~~~还有就是训练关尽量不要跳~~~因为其实在训练关还是能学到不少东西的~~~
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-12 10:08:54 | 显示全部楼层
fwjmath的介绍不错,我昨天在家里玩到4-2还是4-3的时候卡关了
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-12 10:54:50 | 显示全部楼层
恩 开始玩的时候请教了 fwjmath 不少  这个教程还是不错的!  但是过了测试就好很多!
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-17 12:57:21 | 显示全部楼层

更新

貌似今天更新了
flod.JPG

锁上所有新功能
new.JPG

加入新的 游戏有
Transduction 4-1

Transduction 4-2
Human Fyn2 3-1
Human Fyn2 3-2
CASP prectice: E.coli
CASP prectice

[ 本帖最后由 zglloo 于 2008-5-17 13:09 编辑 ]
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-17 19:10:20 | 显示全部楼层
看來這個fold it應該是r@h的手動版~
一個自動w~s,另一個就人手操作
宣傳的味道很重~
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-17 19:45:53 | 显示全部楼层

回复 #27 universebreaker 的帖子

这样说的话说明你还不理解为什么计算机技术还不能很好解决蛋白质折叠的问题的原因。
计算机有一个很大的缺点:太短视,很容易掉进局部的最优解跳不出来,现在绝大多数的比较好的算法都是在这里下的功夫。而人的优点就是在这个地方,人有大局观,能够看出来大概怎么样的构型比较有希望,所以人脑加电脑的话解决问题那是事半功倍。
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-18 13:01:28 | 显示全部楼层
比如S@H星尘计划只能依靠人肉眼凭借经验分辩。
回复

使用道具 举报

发表于 2008-5-18 20:02:04 | 显示全部楼层
訓練全都完成了,用了一個小時~
但老是連不上伺服器
不用代理就超時(間中不超)
用了代理就說找不到whoami.csv
是不是sql出了問題?
回复

使用道具 举报

您需要登录后才可以回帖 登录 | 新注册用户

本版积分规则

论坛官方淘宝店开业啦~

Archiver|手机版|小黑屋|中国分布式计算总站 ( 沪ICP备05042587号 )

GMT+8, 2024-3-29 07:21

Powered by Discuz! X3.5

© 2001-2024 Discuz! Team.

快速回复 返回顶部 返回列表